Кальдера Нгоронгоро создала из-за замкнутого простанста создала уникальную среда обитания для многих видов животных. Сейчас тут периодически обитает боле 25 тысяч животных, причем плотность хищников на квадратный километр самая высокая в Африке. В основном Нгоронгоро находятся стада зебр, буйволов и большое разнообразие антилоп антилоп мигрирующих сюда из Серенгети, а на все эти огромные массы травоядных охотятся живущие здесь прайды львов и леопардов. Также в Нгоронгоро можно встретить чёрных носорогов, слонов и даже бегемотов.
В чаше кратера появилось озеро Магади, знаменитое своей популяцией фламинго.
В 1979 году кратер Нгоронгоро был включён в список Всемирного наследия ЮНЕСКО в качестве выдающегося памятника природы, а в 1981 году признан как биосферный заповедник.